真空化妝品凍干機原料的工作流程：是把預先處理好化妝品溶液制劑或原料，裝盤放入凍干機物料倉體進行預凍結晶（由制冷系統制冷），然后通過真空泵對凍干箱體抽真空，此時化妝品制劑物料的固態冰，在真空環境下開始直接升華為氣體，為了化妝品凍干升華效率，通過化妝品凍干機加熱系統提供所需的熱量，在不影響凍干效果的情況下加速升華。整個冷凍干燥過程通過冷凍干燥機的PLC電控系統控制運行。
真空凍干化妝品原料工藝是通過制藥型真空冷凍干燥機將需要干燥的制品在低溫下（可達-70℃以下）使其所含的水分凍結，然后在真空的環境下干燥，讓水分由固體狀態直接升華為水蒸氣并從制品中排除而使制品干燥。
凍干粉產品生產工藝跟一般液態單元是相同的，所用原料為水及水溶性原料，經完全溶解后配制成均勻的液體，灌裝于西林瓶后經真空冷凍干燥，產品*終的物理狀態由液體變成了凍干粉，是為了更好地保護產品的生物活性成分以及便于保存并延長保存期。